随着创客实验室从社会逐步延伸至校园，创客实验室与创客空间的定位有所不同。对于学校教育而言，创客实验室的价值在于创意的成型与商业化，其重点是创造一个环境培育学生的创客思维，追求的不是一个思想结果，而是一个思维过程。因此，学校创办一个符合学校教育需求的创客实验室，去照搬现在商业社会的创客模式并不合适。校园创客实验室主要定位的主题偏向智能机器人、Arduino、3D打印、手工制作、激光切割等。
化学前处理室应设置紧急喷淋装置和淋浴装置，同时还需要在化学前处理室邻近区域放置救护箱；洗涤室应设置在具有良好排水功能的区域，但不宜与高温室相邻或其他有强电磁辐射的区域相邻。
室内设有试剂柜、存放器具或材料的专柜、实验台、电炉、冰箱和上下水道、电源等。灭菌室主要用于培养基的灭菌和各种器具的灭菌，室内应备有高压蒸汽灭菌器、烘箱等灭菌设备及设施。
准备室准备室，用于准备培养基和样品处理。室内试剂柜、用于存放器具或材料的计数器、试验台、电炉、冰箱和水和污水、电源等。用于洗涤用具等的洗手间洗涤室有时会出现病原微生物，因为用过的器具已被微生物污染。实验室设计前应根据该实验流程来确定仪器的种类、数量、规格型号、外形尺寸、电压功率等参数以及摆放位置，设计师针对性的做出仪器电源、给排水、供气、纯净水以及排风管道接口的设计。
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