实验台的安装：一排课桌前沿与黑板的水平距离不应小于2.5米，后一排课桌后沿与黑板的水平距离不应大于9.5米。教室中间纵向走道宽度和课桌端部与墙面（或突出墙面的内壁及调和管道）的净距离，不应小于0.55米。仪器室：食品及准备室与实验室个数比为1：1，室内使用面积：新室不少于40平方米，旧室不少于33平方米。班额超过45人应按两人一组增加仪器设备。平等班多于6个应配双套。
平面设计应严格划分。对于有2~4个生物安全实验室的建筑物，应划分污染区域、半污染区域和清洁区域。建筑结构应特别加强，3级实验室应采用单层结构，4级必须采用。污染控制设计的动态隔离是核心。通风方式有两种：强力排风和全室换风。 强力排风可用通风柜(橱)，主要用于干法炭化、湿法消化、以及使用有毒有害气体和一些产生有毒有害气体的试验。
实验区域与办公区域分开，设备配件室和其他公共区域可置于两者中间；试剂存放室、气瓶室以及废液存放室不应设置于邻近办公区区域；对容易造成交叉污染又难于有效隔离的实验室，不宜设置在同一区域或邻近区域，大型精密仪器室按仪器的类型，一般分为光谱室、气相色谱室和液相色谱室。安装大型仪器的实验室，应安装专门的制冷设备，以保证室温和湿度的控制。
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