实验室建筑设计的准备工作：（1）总体布局中的各栋建筑物的相互关系以及生活区采用什么方式解决；（2）各类实验楼的工艺布局及工艺流程；（3）平面组合的几种可能性，建设实验楼的层数；（4）选择合适的摸数（包括开间、进深、层高以及走道尺寸）；（5）主要仪器设备的布置方式以及实验台、通风柜等的位置；（6）实验室与研究室之间的布局形式，辅助实验室与实验室之间的布局。
实验室应有管道排气系统，风向从“洁净区”到“污染区”。排出的空气不再循环至建筑物内的任何其他区域。外部排气口要远离有人区、进风口，否则需经过HEPA过滤。实验人员必须证实进入实验室的风向是正确的。建议在实验室的入口处设置可视的监视装置，表明和证实进风的风向。要考虑安装HVAC控制系统，防止实验室持续正向增压。同时应安装声音报警装置，警告实验人员HVAC系统出了问题。并且至少每年要测试HEPA系统，确保工作正常。
实验室设计前应根据该实验流程来确定仪器的种类、数量、规格型号、外形尺寸、电压功率等参数以及摆放位置，设计师针对性的做出仪器电源、给排水、供气、纯净水以及排风管道接口的设计。每个仪器间单独设置房间终端配电箱，且主要仪器需要单独留出一个回路，不能与房间照明或其他插座串联，这样主要是满足仪器设备的使用和维护要求。楼层配电箱应安置在的配电房，设置门锁，需专人管理。
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