因为实验室的特殊性，实验室装修工作要综合考虑实验室整体规划、合理布局和平面设计，多工种、多工序之间需要无缝衔接。装修前要科学测算实验室仪器用电功率及电力分配；针对实验室的特点合理选用各类装饰材料。环境监测实验室可能用到的大型精密仪器主要包括原子吸收光谱仪、原子荧光光谱仪、电感耦合等离子体发射光谱仪、电感耦合等离子体质谱仪、气相色谱仪、气相色谱质谱联用仪、液相色谱仪等设备。
实验室的位置应该合理，例如，选择灰尘小、震动的地方。外壳结构应考虑防震、防尘、防潮，且绝缘性好，光线充足，每个工作室的布局原则是限制样品的流通面积，缩短样品流量行程，尽量减少流动（样品）和人员线路交叉。生活用水和检测用水必须分开，以确保生活用水和水管的相对独立性，以避免相互混合，特别是确保生活用水不被化学试剂污染。实验室布局合理，操作安全、方便，可以避免污染，可以满足工作需要，保证测试结果不受干扰。
准备室准备室，用于准备培养基和样品处理。室内试剂柜、用于存放器具或材料的计数器、试验台、电炉、冰箱和水和污水、电源等。用于洗涤用具等的洗手间洗涤室有时会出现病原微生物，因为用过的器具已被微生物污染。实验室设计前应根据该实验流程来确定仪器的种类、数量、规格型号、外形尺寸、电压功率等参数以及摆放位置，设计师针对性的做出仪器电源、给排水、供气、纯净水以及排风管道接口的设计。
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